Abu Mena ligt ten zuiden van Alexandrië, tussen Wadi el-Natrun en Alexandrië zelf. De kerk, doopkapel, basilieken, openbare gebouwen, straten, kloosters, huizen en werkplaatsen in deze vroegchristelijke heilige stad werden gebouwd boven het graf van de martelaar Menas van Alexandrië, die stierf in het jaar 296. Menas was een Alexandrijnse soldaat die opkwam voor de christenen en zijn christendom in het openbaar verklaarde. Hierdoor was de oase rond 600 uitgegroeid tot een bedevaartstad. De grote basiliek werd in de 5e eeuw gebouwd voor het toenemende aantal christelijke pelgrims.